Для того, чтобы получить Супер Изумруды, необходимо собрать обычные [[Chaos Emeralds|Изумруды Хаоса]] до уровня [[Mushroom Hill Zone]]. Начиная с этого уровня, в игре появляются новые переливающиеся гигантские кольца, доставляющие героев в Потайной дворец к [[Master Emerald|Мастеру Изумруду]], где собранные 7 [[Chaos Emeralds|Изумрудов Хаоса]] превратятся в крупные тусклые камни на пъедисталах. Запрыгнув на любой из Изумрудов игрок попадает на спец-этап из игры [[Sonic & Knuckles]]. По прохождении спец-этап Изумруд становится цветным. У каждого Супер Изумруда свой спец-этап и цвет. Когда все Супер Изумруды засияют, открывается новые формы игроков. [[Sonic the Hedgehog|Соник]] становится [[Hyper Sonic|Гипер Соником]], [[Knuckles the Echidna|Наклз]] - [[Hyper Knuckles|Гипер Наклзом]], а [[Miles "Tails" Prower|Теилз]] - [[Super Tails|Супер Теилзом]].